微生物胞外代谢物对高草草原植物根系分泌物的响应

由 root 提交于 周日, 05/31/2026 - 18:47
根系分泌物会影响土壤微生物群落的组装与功能,然而在受控条件下,植物物种特异性对微生物驱动代谢转化的影响仍未得到充分表征。本文展示了一个涵盖六种植物的分泌物—微生物相互作用多组学数据集,其中包括高草草原物种(Helianthus pauciflorus、Carex brevior、Eragrostis spectabilis、Astragalus canadensis 和 Panicum virgatum)以及一种模式禾草(Brachypodium distachyon),该数据集通过体外孵育实验获得。采用无菌根系分泌物对接种了本地高草草原土壤微生物组的类土壤培养基进行修饰。该数据集包括用于微生物群落谱系分析的全长 16S rRNA 基因测序、用于外代谢组分析的非靶向 LC-MS/MS 代谢组学,以及微生物生长的光密度测量。我们描述了无菌植物培养方案、实验设计、数据采集、处理流程以及技术验证。该数据集为研究不同植物物种间微生物介导的外代谢物转化提供了资源,有助于理解根际过程、微生物组组装和生态系统功能。

根系分泌物会影响土壤微生物群落的组装与功能,然而在受控条件下,植物物种特异性对微生物驱动代谢转化的影响仍缺乏充分表征。在此,我们提出一个涵盖六种植物的分泌物—微生物相互作用多组学数据集,其中包括高草草原物种(Helianthus pauciflorus、Carex brevior、Eragrostis spectabilis、Astragalus canadensis 和 Panicum virgatum)以及一种模式禾草(Brachypodium distachyon);该数据集通过体外孵育实验生成。采用无菌根系分泌物对接种有本地高草草原土壤微生物组的类土壤培养基进行修饰。该数据集包括用于微生物群落谱分析的全长16S rRNA基因测序、用于外代谢组谱分析的非靶向LC-MS/MS代谢组学,以及微生物生长的光密度测量。我们描述了无菌植物培养方案、实验设计、数据采集、处理流程以及技术验证。该数据集为研究不同植物物种间微生物介导的外代谢物转化提供了资源,有助于理解根际过程、微生物组组装及生态系统功能。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.29.728892v1?rss=1

🏷️ 根系分泌物 土壤微生物组 外代谢组学 高草草原 植物-微生物互作 16S rRNA测序