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由产气荚膜梭菌（Clostridium perfringens）引起的坏死性肠炎（necrotic enteritis，NE）是家禽中一种主要的肠道疾病，具有显著的经济影响。NE常由艾美耳球虫属（Eimeria spp.）共感染所诱发，然而，艾美耳球虫与产气荚膜梭菌在NE诱导的菌群失调及疾病进展中的相对贡献仍缺乏明确定义。为此，本研究对Cobb肉鸡分别进行Eimeria maxima、产气荚膜梭菌或二者联合攻毒，并采用16S rRNA基因测序和鸟枪法宏基因组测序分析回肠和盲肠微生物群。进一步地，在感染后多个时间点对肠道微生物群变化的时间动态进行了评估。 研究结果表明，NE相关菌群失调的特征为条件致病菌富集，包括产气荚膜梭菌、大肠杆菌（Escherichia）和鸡肠球菌（Enterococcus cecorum），同时某些乳酸及短链脂肪酸产生菌的丰度发生差异性变化。菌群失调和疾病进展由E. maxima与产气荚膜梭菌之间的协同作用所驱动，其中E. maxima发挥主导性影响。值得注意的是，即使在未事先暴露的情况下，E. maxima单独感染也可促进共栖性产气荚膜梭菌或其近缘细菌的扩增。对盲肠微生物群的宏基因组分析进一步揭示，在E. maxima和NE攻毒条件下，微生物群的功能发生转变，更倾向于利用宿主来源聚糖和简单碳水化合物，而非膳食纤维。这一转变与E. maxima诱导的上皮损伤、黏液生成增加以及营养吸收不良相一致。NE相关菌群失调在E. maxima感染后第4天出现，并在产气荚膜梭菌攻毒后2–3天达到峰值。这些结果表明，艾美耳球虫感染可形成有利于产气荚膜梭菌定植和增殖的肠道环境，突显了其在NE发病机制中的关键作用。
坏死性肠炎中的肠道菌群失衡：剖析艾美耳球虫和产气荚膜梭菌的作用 | bioRxiv
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坏死性肠炎中的肠道菌群失衡：剖析艾美耳球虫和产气荚膜梭菌的作用
Jing Liu， Jiaqing Guo， Melanie A. Whitmore， Isabel Tobin， Dohyung M. Kim， Guolong Zhang
doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.27.728132
Jing Liu 俄克拉荷马州立大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-ND 4.0 国际许可协议公开提供。
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发表于 2026 年 5 月 30 日。
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Jing Liu， Jiaqing Guo， Melanie A. Whitmore， Isabel Tobin， Dohyung M. Kim， Guolong Zhang
bioRxiv 2026.05.27.728132； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.27.728132
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Jing Liu， Jiaqing Guo， Melanie A. Whitmore， Isabel Tobin， Dohyung M. Kim， Guolong Zhang
bioRxiv 2026.05.27.728132； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.27.728132
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.27.728132v1?rss=1
🏷️ 坏死性肠炎 肠道菌群失调 艾美耳球虫 产气荚膜梭菌 宏基因组测序 家禽肠道疾病