人类端粒染色质在血浆游离DNA中的片段化模式

端粒处独特的染色质结构可保护染色体的线性末端免受DNA监视机制的识别。在本研究中，我们证明来自血浆的循环游离DNA（cfDNA）能够用于描绘端粒处的染色质结构。我们发现，端粒6聚体重复序列（TTAGGG/CCCTAA）是cfDNA中最丰富的循环6聚体。cfDNA中的端粒序列包含不同于基因组其余区域的亚核小体足迹，这些足迹源于富含C链中的特异性切割，并且其核小体重复长度为145 bp，显著短于全基因组范围内观察到的约170 bp。cfDNA中端粒足迹的丰度随年龄增长而下降，而这一下降在先天性角化不良（DC）这一端粒生物学疾病中进一步加剧。基于cfDNA的启动子亚核小体富集可识别DC特异性的基因特征，这些特征能够反映疾病状态，并显示出向染色体末端富集的趋势。在本研究中，我们证明cfDNA能够以无创方式捕获端粒染色质结构及其全基因组范围的影响，包括DC中的疾病特异性特征。

端粒处独特的染色质结构能够保护染色体线性末端免受DNA监视机制的识别。在此，我们证明了来源于血浆的循环游离DNA（cfDNA）可用于描绘端粒处的染色质结构。我们发现，端粒6聚体重复序列（TTAGGG/CCCTAA）是cfDNA中最丰富的循环6聚体。cfDNA中的端粒序列包含不同于基因组其余区域的亚核小体足迹，这些足迹来源于富含C链中的特异性切割；其核小体重复长度为145 bp，显著短于全基因组范围内观察到的约170 bp。

cfDNA中端粒足迹的丰度随年龄增长而下降，而先天性角化不良（Dyskeratosis Congenita，DC）这一端粒生物学相关疾病会进一步加剧这种下降。基于cfDNA的启动子亚核小体富集可识别DC特异性的基因特征，这些特征反映疾病状态，并显示出向染色体末端富集的趋势。在本研究中，我们证明了cfDNA能够以非侵入性方式捕获端粒染色质结构及其在全基因组范围内的影响，包括DC中的疾病特异性特征。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.28.728442v1?rss=1

🏷️ 端粒染色质 循环游离DNA 片段化模式 核小体足迹 先天性角化不良