枯草芽孢杆菌中夹钳结合分子决定因素的表征

在细菌中，环状滑动夹蛋白DnaN是复制机器中的关键组成部分。在复制过程中，滑动夹环绕亲本DNA链，并结合DNA聚合酶及其他复制和修复蛋白，从而帮助将它们锚定在DNA链上的作用位点。这些结合伙伴通过称为夹结合基序（clamp-binding motifs, CBMs）的短五肽或六肽序列与滑动夹相互作用。尽管在不同细菌物种中已鉴定出保守的CBM序列，但关于滑动夹结合的大多数研究都集中于模式革兰氏阴性细菌大肠杆菌（Escherichia coli），而对其他细菌物种中的滑动夹结合机制了解较少。 在本研究中，我们考察了模式革兰氏阳性细菌枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）中的滑动夹结合。我们采用荧光偏振结合测定，定量分析了一系列CBM肽与大肠杆菌和枯草芽孢杆菌滑动夹的结合。我们鉴定出两种物种在滑动夹结合方面的相似性，包括保守五肽基序中不同氨基酸的重要性相近。然而，我们的结果也揭示了这两种物种之间在滑动夹结合上的差异。最显著的是，我们发现，尽管五肽CBM与大肠杆菌和枯草芽孢杆菌滑动夹的结合亲和力相似，但六肽CBM与枯草芽孢杆菌滑动夹的结合却弱了一个数量级。我们的结果为细菌中的滑动夹结合提供了新的见解，并指出这种关键相互作用可能存在物种特异性的差异。

在细菌中，环状滑动夹DnaN是复制机器的一个必需组分。复制过程中，该夹环绕亲本DNA链，并结合DNA聚合酶及其他复制和修复蛋白，帮助将它们锚定在DNA链上的作用位点。这些结合伙伴通过称为夹结合基序（clamp-binding motifs，CBMs）的短五肽或六肽序列与夹相互作用。尽管在不同细菌物种中已经鉴定出保守的CBM序列，但关于夹结合的大多数研究都集中于模式革兰氏阴性菌大肠杆菌（Escherichia coli），而对其他细菌物种中的夹结合机制了解相对较少。在本研究中，我们考察了模式革兰氏阳性菌枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）中的夹结合。我们采用荧光偏振结合测定，定量分析了一系列CBM肽与大肠杆菌和枯草芽孢杆菌夹的结合。我们鉴定出这两个物种在夹结合方面的相似性，包括保守五肽基序内不同氨基酸的重要性相近。然而，我们的结果也揭示了这两个物种之间夹结合的差异。最显著的是，我们发现，尽管五肽CBM与大肠杆菌和枯草芽孢杆菌夹的结合亲和力相似，但六肽CBM与枯草芽孢杆菌夹的结合亲和力要弱一个数量级。我们的结果为细菌中的夹结合提供了新的见解，并指出这种关键相互作用可能存在物种特异性差异。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.27.728225v1?rss=1

🏷️ 枯草芽孢杆菌 滑动夹蛋白DnaN 夹结合基序 DNA复制 蛋白质相互作用