凤蝶科中高质量染色体尺度组装仍然稀缺。这限制了比较基因组学研究主要集中于模式物种——鳞翅目家蚕（Bombyx mori）。在此，我们报道了欧里墨蝶 Parides eurimedes mylotes 的单倍型分相染色体水平基因组组装。我们采用 PacBio HiFi 测序并使用 hifiasm 进行组装。最终的单倍型组装（Hap1 和 Hap2）长度分别为 274 Mb 和 270 Mb。这些组装被组织为 31 条近端粒到端粒染色体，其 scaffold N50 值分别为 9.72 Mb 和 9.22 Mb。BUSCO 分析显示，Hap1 和 Hap2 的组装完整性分别为 96.6% 和 96.4%。重复序列注释鉴定出 18–19% 的重复内容，其中 Helitron 元件是主要的转座元件类别。我们鉴定了 W 和 Z 性染色体，并完整组装了线粒体基因组。与此前可获得的 Parides photinus 草图组装相比，我们的基因组在 scaffold 碎片化程度上降低了 11,000 倍，并实现了近乎完整的基因组装。该组装为凤蝶科的功能、进化及多组学研究提供了稳健的基因组参考。 除作为凤蝶科的高质量基因组参考外，该组装对于将蝴蝶翅的遗传结构与结构色形成所依赖的层级纳米结构联系起来也至关重要。通过鉴定参与鳞片形态发生的基因及其调控网络，我们能够将蝴蝶的基因型与其光子学功能相关联。对生物光子系统进化起源的这一认识，将为仿生结构色材料的设计提供启示。
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凤蝶 Parides eurimedes mylotes 的染色体水平基因组组装是研究翅膀着色的重要资源
查看 ORCID 个人资料 Praveen Kumar Jaya Balaji ， Tim Davalan ， 查看 ORCID 个人资料 Pamela Nicholson ， Carmen Rojas Uglade ， 查看 ORCID 个人资料 Laurent Falquet ， 查看 ORCID 个人资料 Viola Valentina Vogler-Neuling
doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.27.728091
Praveen Kumar Jaya Balaji 1 弗里堡大学与 NCCR Bio-inspired Materials； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得重复使用。
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Praveen Kumar Jaya Balaji ， Tim Davalan ， Pamela Nicholson ， Carmen Rojas Uglade ， Laurent Falquet ， Viola Valentina Vogler-Neuling
bioRxiv 2026.05.27.728091； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.27.728091
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Praveen Kumar Jaya Balaji ， Tim Davalan ， Pamela Nicholson ， Carmen Rojas Uglade ， Laurent Falquet ， Viola Valentina Vogler-Neuling
bioRxiv 2026.05.27.728091； doi： https://doi.org/10.64898/2026.05.27.728091
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.27.728091v1?rss=1
🏷️ 染色体水平组装 蝴蝶基因组 翅膀着色 结构色 比较基因组学 性染色体