- 5 次围观
引言:环状RNA数量性状位点(circQTL)已成为一类新兴的调控变异,但其机制基础仍缺乏充分表征。理解遗传变异如何影响circRNA生物发生,对于阐明其在转录后基因调控中的作用至关重要。 方法:我们系统比较了circQTL与匹配的剪接数量性状位点(sQTL)和表达数量性状位点(eQTL)数据集。基于自助法(bootstrap)的Jaccard相似性分析,我们量化了基因组重叠模式并评估了其统计学显著性。我们进一步在独立的circQTL研究中验证了这些发现。此外,我们还分析了circQTL的基因组分布,以识别其在功能基因组区域中的富集模式。 结果:与eQTL相比,circQTL与sQTL表现出统计学显著但幅度较小的更强基因组重叠。这一模式在独立数据集中保持一致,尽管单个circQTL信号的可重复性有限。基因组注释揭示了不同的分布模式,包括在外显子区域中的缺失,以及相较于其他QTL类别在非编码基因组环境中的相对富集。 讨论:综上所述,这些结果表明,与circRNA相关的调控变异优先与剪接相关机制相联系,而非宿主基因的转录调控。然而,较小的效应量表明这种关系并非排他性的,更可能反映了共享的剪接位点调控效应与回剪接特异的额外机制的混合,而这些机制并未被传统的sQTL或eQTL框架所捕捉。这种双重架构使circRNA生物发生处于剪接动力学、RNA结构以及高阶基因组组织的交界面,支持将circQTL视为转录后基因调控的一个独特层次。
环状RNA相关QTL与剪接QTL的关联强于与表达QTL的关联 | bioRxiv
跳转至主要内容
首页 关于 投稿 提醒 / RSS 搜索此关键词 高级搜索 新结果
环状RNA相关QTL与剪接QTL的关联强于与表达QTL的关联
查看 ORCID 资料 Aitor Zabala, 查看 ORCID 资料 Alex M Ascension, 查看 ORCID 资料 Saioa Gs Iniguez, 查看 ORCID 资料 Leire Iparraguirre, 查看 ORCID 资料 Eduardo Andres-Leon, 查看 ORCID 资料 Fuenzisla Matesanz, 查看 ORCID 资料 David Otaegui, 查看 ORCID 资料 Maider Munoz-Culla
doi: https://doi.org/10.64898/2026.05.29.728707
Aitor Zabala 1 Biogipuzkoa HRI; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY-NC 4.0国际许可协议 进行提供。
查看讨论主题。 返回顶部 上一篇 下一篇
发布于2026年5月29日。 下载PDF 数据/代码 电子邮件
感谢您有兴趣帮助传播bioRxiv。 您的电子邮件 * 您的姓名 * 发送至 * 请输入多个地址,每行一个,或用逗号分隔。
您将通过电子邮件发送以下内容 环状RNA相关QTL与剪接QTL的关联强于与表达QTL的关联
消息主题 (您的姓名)已从bioRxiv转发一个页面给您
消息正文 (您的姓名)认为您会希望查看bioRxiv网站上的此页面。
您的个人留言
验证码 此问题用于测试您是否为人工访客,并防止自动化垃圾信息提交。
分享 环状RNA相关QTL与剪接QTL的关联强于与表达QTL的关联
Aitor Zabala , Alex M Ascension , Saioa Gs Iniguez , Leire Iparraguirre , Eduardo Andres-Leon , Fuenzisla Matesanz , David Otaegui , Maider Munoz-Culla
bioRxiv 2026.05.29.728707; doi: https://doi.org/10.64898/2026.05.29.728707
分享本文: 复制 引文工具
环状RNA相关QTL与剪接QTL的关联强于与表达QTL的关联
Aitor Zabala , Alex M Ascension , Saioa Gs Iniguez , Leire Iparraguirre , Eduardo Andres-Leon , Fuenzisla Matesanz , David Otaegui , Maider Munoz-Culla
bioRxiv 2026.05.29.728707; doi: https://doi.org/10.64898/2026.05.29.728707
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.29.728707v1?rss=1
🏷️ 环状RNA circQTL 剪接QTL 表达QTL 转录后调控