WD40 结构域共享一种广泛存在的 β-螺旋桨折叠，并且常常作为多功能支架蛋白发挥作用。尽管它们在组织动态细胞复合物中具有核心作用，许多 WD40 蛋白的分子与结构机制仍然知之甚少。其中，DCAF7 是一种在人类中普遍表达且必需的基因，同时也编码一种在真核生物中高度保守的 WD40 蛋白。已知它可与多个在功能上多样化的相互作用伙伴结合，以协调若干蛋白激酶以及转录调控因子的细胞活性，从而调节细胞生长、分化和转录调控等关键细胞过程。然而，DCAF7 的精确作用方式尚不清楚，而且其序列相较于表征更为充分的 WD40 蛋白存在显著差异，因此无法通过相似性进行信息迁移。
结构互作组学能够揭示生物体内蛋白质—蛋白质相互作用（PPI）的发生方式，对于理解生物学功能和开发新的治疗策略至关重要。利用 SLiMAn2、AlphaFold2/3 和 PSSMsearch，我们在若干已知的 DCAF7 相互作用伙伴中鉴定出一种保守的 α-螺旋短线性基序（SLiM），该基序可结合于其 β-螺旋桨的顶部表面。随后，我们利用该基序构建了一个正则表达式，以在 DCAF7 元互作组以及人类蛋白质组中识别潜在的新型直接结合蛋白。对于其他一些相互作用伙伴，还预测了结构域—结构域相互作用。最后，对包含这些新命中蛋白的寡聚复合物进行建模，揭示了 DCAF7 支架作用的结构基础，并将其与自闭症等神经发育障碍联系起来。
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🏷️ DCAF7 WD40结构域 蛋白质互作 结构互作组学 短线性基序 AlphaFold