嵌合RNA检测和验证技术

嵌合RNA（chimeric RNA）是由来自不同基因的外显子片段组成的融合转录本。传统的嵌合RNA检测方法有染色体核型分析、荧光原位杂交（FISH）等，但这些技术的特异性、灵敏性和准确性较差。随着测序技术的发展，二代测序技术展现出强大的数据处理能力，可以通过高通量序列分析来检测嵌合RNA，目前基于高通量测序的检测方法有FusionCatcher、SOAPfuse、EricScript等。目前较为常用的对检测到的嵌合RNA的验证方法有聚合酶链反应（PCR）、核糖核酸酶保护实验（RPA）、琼脂糖凝胶电泳、Sanger测序等。多种检测技术的开发使得越来越多的嵌合RNA被发现，但现有的检测技术各有优劣，主要体现于检测成本、假阳性率、检测时间等方面的差异。本文对嵌合RNA的检测方法、验证方法及各方法的优劣性进行阐述。