斑翅果蝇解毒代谢相关基因的鉴定与分析

root 提交于 周五, 11/24/2023 - 00:26
根据斑翅果蝇(<i<Drosophila suzukii</i< Matsumura)的转录组数据,通过序列分析、进化分析、结构域及保守氨基酸分析,鉴定出5种斑翅果蝇的解毒代谢基因,包括ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter, ABCs)、细胞色素P450单加氧酶(cytochrome P450, CYPs)、谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione S-transferases,GSTs)、羧酸酯酶(carboxylesterases,CarEs)、尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UDP-glucuronosyl transferases, UGTs)。进化分析结果显示,斑翅果蝇的CYPs基因分布于<i<CYP3</i<、<i<CYP4</i<、<i<CYP6</i<、<i<CYP9</i<四个进化分支,ABCs基因分布于<i<ABCC</i<、<i<ABCD</i<、<i<ABCF</i<、<i<ABCG</i<四个亚家族, GSTs基因分布于<i<GST-Delta</i<、<i<GST-Epsilon</i<、<i<GST-Theta</i<以及<i<GST-Zeta</i<四个进化分支,斑翅果蝇的CarEs基因和UGTs基因与亚艳丽果蝇(<i<Drosophila subpulchrella</i<)的遗传距离最近;结构域及保守氨基酸分析结果表明所有的CYPs均包含P450结构域;ABCs中都包含ABC2结构域;在GSTs中都含有GST结构域;在CarEs中包含Coesterases结构域;在UGTs中含有UDPGT结构域。CYPs的保守基序为EEGGKKRNDFLDLLJZLKKEG,ABCs的保守基序为DCPSASNPADYIIE,GSTs的保守基序为LYPKDLVKRAVVDQRLHFE。

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