普通大蓟马Mu<i<Rhodopsin</i<基因的全长克隆及生物信息学分析

为了解蓟马害虫视蛋白分子结构及特征，根据普通大蓟马（<i<Megalurothrips usitatus</i<）转录组信息克隆获得了视紫红质Mu<i<Rhodopsin</i<的基因cDNA全长，并利用DNAMan 9.0和 SWISSMODEL等软件对视紫红质Mu<i<Rhodopsin</i<的基因进行序列同源性比对并构建基因系统进化树，分析理化性质及结合域特点，并对该蛋白进行结构预测。结果表明：该基因全长1 140 bp，共编码380个氨基酸，相对分子质量为 42.73 kDa，理论等电点为8.47。序列比对以及同源性分析结果表明，Mu<i<Rhodopsin</i<为横纹视紫红质(rhabdomeric opsins, r-opsins)与西花蓟马（<i<Frankliniella occidentalis</i<）及棕榈蓟马（<i<Thrips palmi）</i<具有高度同源性。结构域分析表明该蛋白具有7个跨膜结构域，包含了1个G蛋白偶联受体家族区域，隶属于G蛋白偶联受体家族；具有6个N-豆蔻酰化位点，3个N-糖基化位点，3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点，4个蛋白激酶C磷酸化位点；其第322位氨基酸—赖氨酸（K）为与发色团（视黄醛）的重要结合位点，具有典型的视蛋白能够激活IP3/Ca<sup<2+</sup<信号通路引起光依赖的去极化反应。