贝莱斯芽孢杆菌HN-2次生代谢产物处理下黄单胞菌(<i<Xoo</i<)的转录组分析

root 提交于 周四, 07/27/2023 - 21:49
为探究贝莱斯芽孢杆菌(<i<Bacillus velezens</i<)菌株HN-2正丁醇提取物对黄单胞菌(<i<Xoo</i<)的抑菌机制,分别用菌株HN-2正丁醇提取物和杆菌肽处理12 h后的<i<Xoo</i<进行转录组测序(RNA-seq)并利用GO数据库和KEGG数据库对转录组数据进行分析。转录组数据分析结果表明,HN-2正丁醇提取物和杆菌肽处理后<i<Xoo</i<菌内均有大量差异表达基因(DEGs),HN-2处理组共得到1 512个差异表达基因,其中上调表达基因871个,下调表达基因641个;GO富集分析发现HN-2正丁醇提取物处理后,<i<Xoo</i<的差异表达基因主要聚类在代谢过程、细胞组分、大分子复合物、催化活性等方面;KEGG聚类分析发现HN-2正丁醇提取物处理后,核糖体途径所包含的差异表达基因数目最多,差异最显著,其余主要参与的代谢途径有淀粉和蔗糖代谢、苯甲酸酯降解、甘油磷脂降解、细菌趋化性等。结果表明,HN-2正丁醇提取物主要影响<i<Xoo</i<的核糖体途径、淀粉和蔗糖代谢途径、细菌趋化性途径。

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