FtsZ靶向多肽抑制剂的分子对接、分子动力学分析及抗菌活性评价

为了得到靶向FtsZ的潜在肽类抑制剂和对其作用机制进行探究，采用分子对接方法筛选靶向金黄色葡萄球菌FtsZ蛋白的肽类化合物配体，利用分子动力学方法分析筛选到的配体与FtsZ蛋白结合状态的动态变化，计算配体重原子位置均方根偏差（RMSD）和相互作用能（Interaction energy）。在分子动力学分析基础上，分析以上短肽配体的抗菌活性，测定其对GTP酶活性的影响。结果表明，TE101、PE101、PE102、PE103和PE104五个多肽对于金黄色葡萄球菌的生长有抑制作用，且该作用与FtsZ蛋白GTPase活性无关。