基于宏基因组测序的橡胶林病原微生物的分析

为了解橡胶[ Hevea brasiliensis (H. B. K.) Muell.-Arg.]林土壤和根系（根际和根表）广谱病原微生物的组成及其影响因素，以海南（儋州、万宁和乐东）和西双版纳（景洪、勐仑和勐满）地区健康橡胶林的土壤、根际和根表为材料，采用宏基因组测序技术，分析橡胶林病原微生物的组成及其影响因素。结果表明，植物病原微生物在门的水平为变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）和子囊菌门（Ascomycota）；病原微生物在属水平为假单孢菌属（<i<Pseudomonas</i<）、劳尔氏菌属（<i<Ralstonia</i<）、伯克霍尔德氏菌属（<i<Burkholderia</i<）、链霉菌属（<i<Streptomyces</i<）、农杆菌属（<i<Agrobacterium</i<）、黄单胞菌属（<i<Xanthomonas</i<）、泛菌属（<i<Pantoea</i<）、麦角菌属（<i<Clavibacter</i<）、果胶杆菌属（<i<Pectobacterium</i<）和木质部小菌属（<i<Xylella</i<），在属水平上主要以子囊菌门为主。海南和西双版纳地区的根际病原微生物在属水平上无显著差异。土壤和根际样本病原微生物组成相似，各根表样本病原微生物组成相似，硝态氮与病原微生物呈显著正相关。